一般來說,水和沉積物中含有大量的鈣離子,堿度較高的池塘不宜施用生石灰,因為如果再次施用生石灰,磷酸鹽沉淀越固定越完整,會降低水中有效磷的濃度,造成水體缺磷,影響甚至限制水生植物的生長。
藻類豐富、pH值高的水,生石灰往往會引起堿中毒或大量藻類死亡,導致水質惡化、魚蟹蝦死亡等。藍藻爆發的水體pH值高,生石灰會促使藍藻瘋狂生長。使用生石灰后,會造成水體缺磷,影響甚至限制水生植物的生長,可能導致養魚產量低。當老化的水和水體老化(發臭)時,水中往往會有大量的氨氮物質。
當生石灰使用后pH值升高時,會引起分子態氮迅速增加,毒性可能是原來的幾百倍,容易導致魚類氨中毒。臭水往往含有大量的氨氮。使用生石灰后,pH值迅速上升,會導致分子態氮迅速上升,毒性是原來的幾百倍,引起氨中毒。